美國哈佛醫(yī)學(xué)院Joseph Loscalzo研究小組揭示了疾病突變對蛋白質(zhì)相互作用的綜合影響。近日,《自然—遺傳學(xué)》雜志在線發(fā)表了這項成果。
研究人員表明,與疾病相關(guān)的種系變體相比,從項目1000 Genomes和ExAC的健康參與者中鑒定出的變體在編碼蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)相互作用(PPI)接口的序列中顯著富集。與10,861個腫瘤外顯子組中的非接口相比,PPI接口中的體細胞錯義突變也顯著富集。研究人員在全癌分析中通過計算確定了470種可能的oncoPPI,并證明oncoPPI與患者生存率和耐藥性/敏感性高度相關(guān)。
研究人員使用系統(tǒng)性二元相互作用實驗性地驗證了13 oncoPPI的網(wǎng)絡(luò)效應(yīng),并且還證明了其中的兩個對腫瘤細胞生長的功能影響。
總而言之,這種人類相互作用組網(wǎng)絡(luò)框架為區(qū)分具有PPI干擾突變的等位基因提供了一個有力的工具,從而可促進基于病理生物學(xué)機制和基因型的療法發(fā)現(xiàn)。
據(jù)介紹,基因組學(xué)和相互作用組學(xué)的技術(shù)和計算進展使人們能夠確定疾病突變?nèi)绾螖_亂人類細胞內(nèi)的PPI網(wǎng)絡(luò)。
責任編輯:劉東麗
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